建立部門合作與政策協(xié)調(diào)的長效機(jī)制，構(gòu)建責(zé)權(quán)分明、監(jiān)管與操作分離的認(rèn)定管理工作體系，是新《認(rèn)定辦法》在高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作的一次重大改革。

為了做好企業(yè)認(rèn)定和政策落實(shí)工作，新《認(rèn)定辦法》加大了部門合作與政策協(xié)調(diào)力度。科技部與財(cái)政部、國家稅務(wù)總局建立了聯(lián)合工作機(jī)制，省級科技主管部門與同級財(cái)政、稅務(wù)部門共同進(jìn)行高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作，通過這一改革措施，保證認(rèn)定企業(yè)與享受政策同步進(jìn)行。

在組織管理方面，新《認(rèn)定辦法》設(shè)立了“部門決策、地方認(rèn)定、機(jī)構(gòu)監(jiān)管”的認(rèn)定管理工作體系。科技部、財(cái)政部、國家稅務(wù)總局三部門聯(lián)合成立認(rèn)定工作領(lǐng)導(dǎo)小組，作為決策層，研究決定高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作原則，解決科技、財(cái)政、稅務(wù)部門在高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定及相關(guān)政策落實(shí)中出現(xiàn)的重大問題。認(rèn)定工作領(lǐng)導(dǎo)小組下設(shè)辦公室，作為監(jiān)管層，負(fù)責(zé)認(rèn)定工作的備案管理，監(jiān)督、檢查全國高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作和相關(guān)政策的落實(shí)情況。省級科技部門與同級財(cái)政、稅務(wù)部門組成高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理機(jī)構(gòu)，作為認(rèn)定機(jī)構(gòu)，負(fù)責(zé)本地區(qū)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作，并通過會(huì)商制度及時(shí)解決高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定及稅收政策落實(shí)中出現(xiàn)的有關(guān)問題。新《認(rèn)定辦法》還通過公示公告、投訴處理、日常檢查等措施加強(qiáng)過程監(jiān)管，接受社會(huì)監(jiān)督，充分體現(xiàn)了公共政策公開、公平、公正的原則。

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